２０キロ走を行い、各校上位１０人（最大１４人まで参加）の合計タイムで争われる。合計タイム上位６校がまず出場権を獲得。７位以下は、合計タイムから関東学生対抗選手権（関東インカレ）の成績で得た得点をタイムに換算したものを差し引き、その上位３校が出場権を得る。シード校の１０校（０６年箱根駅伝１０位以内）と予選会通過９校に関東学連選抜（後日発表）を加えた計２０チームが来年１月２、３日の本大会に出場する。