| 順位 | チーム | 勝点 | 試合 | 勝数 | 分数 | 負数 | 得点 | 失点 | 点差 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 名古屋グランパス | 72 | 34 | 23 | 3 | 8 | 54 | 37 | 17 |
| 2 | ガンバ大阪 | 62 | 34 | 18 | 8 | 8 | 65 | 44 | 21 |
| 3 | セレッソ大阪 | 61 | 34 | 17 | 10 | 7 | 58 | 32 | 26 |
| 4 | 鹿島アントラーズ | 60 | 34 | 16 | 12 | 6 | 51 | 31 | 20 |
| 5 | 川崎フロンターレ | 54 | 34 | 15 | 9 | 10 | 61 | 47 | 14 |
| 6 | 清水エスパルス | 54 | 34 | 15 | 9 | 10 | 60 | 49 | 11 |
| 7 | サンフレッチェ広島 | 51 | 34 | 14 | 9 | 11 | 45 | 38 | 7 |
| 8 | 横浜F・マリノス | 51 | 34 | 15 | 6 | 13 | 43 | 39 | 4 |
| 9 | アルビレックス新潟 | 49 | 34 | 12 | 13 | 9 | 48 | 45 | 3 |
| 10 | 浦和レッズ | 48 | 34 | 14 | 6 | 14 | 48 | 41 | 7 |
| 11 | ジュビロ磐田 | 44 | 34 | 11 | 11 | 12 | 38 | 49 | -11 |
| 12 | 大宮アルディージャ | 42 | 34 | 11 | 9 | 14 | 39 | 45 | -6 |
| 13 | モンテディオ山形 | 42 | 34 | 11 | 9 | 14 | 29 | 42 | -13 |
| 14 | ベガルタ仙台 | 39 | 34 | 10 | 9 | 15 | 40 | 46 | -6 |
| 15 | ヴィッセル神戸 | 38 | 34 | 9 | 11 | 14 | 37 | 45 | -8 |
| 16 | FC東京 | 36 | 34 | 8 | 12 | 14 | 36 | 41 | -5 |
| 17 | 京都サンガF.C. | 19 | 34 | 4 | 7 | 23 | 30 | 60 | -30 |
| 18 | 湘南ベルマーレ | 16 | 34 | 3 | 7 | 24 | 31 | 82 | -51 |
リーグ戦の順位決定は勝ち点制で、勝ち:3点、引き分け:1点、負け:0点。
勝ち点が同数の場合は(1)全試合を通じて得失点差が多いチーム(2)全試合を通じて総得点が多いチーム(3)当該チームの対戦による、イ)勝ち点、ロ)得失点差、ハ)総得点が多いチーム(4)反則ポイント(5)抽選の順で順位を決める。
16〜18位チームはJ2へ自動降格する。