9日午前6時35分ごろ、東京都新宿区のJR湘南新宿ライン新宿駅で、信号が赤のまま切り替わらなくなった。湘南新宿ラインと、同じ線路に乗り入れる埼京線が全線ストップ。約20分後に運転を再開したが、同8時25分ごろにまた信号が切り替わらなくなり再び約2時間20分にわたり運転を見合わせた。
JR東日本などによると、池袋駅手前で止まった埼京線の電車内で乗客数人が気分の悪さを訴えた。救護活動などのため隣の線路を走る山手線も影響を受け、内回りと外回りが約40分間止まった。
ポイント故障が原因とみられ、JR東日本はポイントを動かすモーターの交換作業をした。